Normalement, le Linksys E3000 est livré avec un CD contenant le logiciel Cisco Connect. Ce logiciel est inséré après vous connectez le routeur à l'ordinateur, et configure le routeur pour utiliser votre connexion Internet sans accès manuel au routeur automatiquement. Toutefois, si vous ne possédez pas le CD ou endommagée, vous pouvez toujours configurer le routeur pour fonctionner avec votre réseau, ainsi que votre connexion Internet.