Alors qu'ils ont tous deux une aigre, goût acidulé, le kéfir et la crème sure peuvent être très différents en termes de texture et de goût. La crème fraîche est toujours faite à partir de crème laitière qui a été fermenté, tandis que le kéfir peut être fait avec du lait ou de la crème laitière ainsi que liquide non-laitiers tels que le lait de noix de coco et de noix laits ou, dans certains cas, eau. Selon sa base, le kéfir peut être utilisé à la place de la crème sure à certaines occasions, comme pour les smoothies ou des desserts, et est naturellement plus faible en gras.