GIMP utilise des couches de combiner deux images en une seule image. Couches sont semblables à une pile de transparents. Lorsque vous ajoutez une couche à une image, il apparaît au-dessus de l'image de base. Quand vous avez ajouté autant de couches que vous le souhaitez, vous pouvez fusionner les couches en une seule image. Certains artistes GIMP utilisent des dizaines de couches pour créer une seule image. Artistes de scrapbook numérique utilisent les couches à ajouter des photos et des embellissements pour un fond «papier».